生物菌剂施用于土壤，主要作用于改良土壤和生根或抑制土传病害，叶面喷施主要是防治病害。冬季大棚在阳光强烈时段，西红柿叶面受紫外线照射，有些生物菌能被杀灭，夜间喷施又增加棚内湿度，因而喷施时间一般为凌晨或下午四点钟后比较适宜。