棉花立枯病俗称棉花黑根病、烂根、腰折病，主要为害棉苗。幼苗出土前可造成烂种。出土后，幼茎基部初现纵褐条纹，条件适宜时迅速扩展绕茎一周，缢缩变细，出现茎基腐或根腐。棉苗失水较快，病死苗易从土中拔出，其基部或根系上可见到稀疏的细丝和粘附其上的小土粒。侵染子叶及幼嫩真叶形成不规则褐色坏死斑，后干枯穿孔。湿度大时病部可见稀疏白色菌丝体，并有褐色的小菌核黏附其上出苗后病害始发期，棉花出苗后可用0.16%棉增灵800倍液、50%多菌灵可湿性粉剂800倍液、50%福美双可湿性粉剂800倍液，或200倍半量式波尔多液，顺棉苗主茎喷雾，使药液顺主茎滴入土壤，每3～5天一次，连续3次。也可用80%退菌特或20%稻脚青可湿性粉剂1000倍液灌根。